Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ankrd33bQ3U0L2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms