Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hace1Q3U0D9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hace1Q3U0D9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms