Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3TTJ4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q3TTJ4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms