Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Ctdnep1Q3TP92 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms