Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarca4Q3TKT4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarca4Q3TKT4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms