Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms