Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vax1Q2NKI2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vax1Q2NKI2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms