Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp2b3Q0VF55 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp2b3Q0VF55 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms