Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrriq1Q0P5X1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrriq1Q0P5X1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms