Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms