Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdx4Q07424 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms