Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Siah1bQ06985 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms