Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms