Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nf1Q04690 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nf1Q04690 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms