Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cxcr5Q04683 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Cxcr5Q04683 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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