Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd1Q04519 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd1Q04519 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms