Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff2Q03404 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff2Q03404 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms