Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms