Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top2aQ01320 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top2aQ01320 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms