Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EgfrQ01279 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EgfrQ01279 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms