Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gabpb2P81069 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gabpb2P81069 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gabpb2P81069 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabpb2P81069 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms