Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb13P70321 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb13P70321 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms