Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkn1P70268 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkn1P70268 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms