Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SbdsP70122 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SbdsP70122 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SbdsP70122 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms