Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Crip1P63254 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms