Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itga11P61622 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms