Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chp1P61022 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms