Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms