Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhbdl3P58873 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms