Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms