Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
AgrpP56473 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms