Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms