Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacnb3P54285 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms