Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms