Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms