Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms