Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms