Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Brca1P48754 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brca1P48754 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brca1P48754 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms