Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VdrP48281 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VdrP48281 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VdrP48281 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VdrP48281 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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