Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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SrprbP47758 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SrprbP47758 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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SrprbP47758 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrprbP47758 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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