Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Klf1P46099 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Klf1P46099 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms