Protein–RNA interactions for Protein: P42208

Sept2, Septin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept2P42208 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sept2P42208 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sept2P42208 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms