Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VhlP40338 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VhlP40338 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VhlP40338 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VhlP40338 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms