Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd1P40201 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd1P40201 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd1P40201 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chd1P40201 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chd1P40201 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chd1P40201 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd1P40201 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd1P40201 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd1P40201 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd1P40201 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chd1P40201 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd1P40201 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms