Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfc1P35601 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms