Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd22P35329 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd22P35329 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms