Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptk2P34152 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms