Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rom1P32958 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rom1P32958 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rom1P32958 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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