Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprmP28828 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms