Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Marcksl1P28667 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Marcksl1P28667 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms